V současné době probíhá územní řízení k projektu Rekonstrukce nelahozeveských tunelů na stavebním úřadě Středočeského kraje.
Spolek Dvořákova stezka z.s. podal přes 20 stran námitek, které se týkají především životního prostředí, zvláště chráněných živočichů žijících na tomto území, kácení dřevin, krajinného rázu, nedostatků v projektové dokumentaci ohledně vlivů stavby na přírodu a krajinu, ovzduší, rozpor s územním plánem obce Nelahozeves a další.
Celkový rozsah plánovaného kácení tak činí dohromady 32.676 m2 zapojených keřů a 3.283 ks stromů (SO 10-83-01). Toto množství má být ovšem nahrazeno pouze 300 ks keřů a stromů. Avšak ne přímo tam, kde by byli vykáceny, tam již není možné je zasadit, nebot tam budou betonové a kamenné zdi.